В мае 1918 года Радола Гайда стал одним из руководителей антибольшевистского выступления Чехословацкого корпуса, организатором восстания в городе Ново-Николаевске. Летом 1918 года — командующий чехословацкими войсками восточнее Омска. Вместе с группой генерала Войцеховского выбил из Екатеринбурга большевиков. В июле 1918 года отбил у красных Иркутск. Назначен Временным Сибирским правительством командующим Екатеринбургской группой Сибирской армии, перейдя на русскую службу с согласия военного министра Чехословакии генерала М.Р Штефаника. Впоследствии — командующий Сибирской армии. Зимой 1918-1919 гг. участвовал во взятии Перми. За штурм Перми Гайда был удостоен ордена св. Георгия 3-й степени. За год дослужился до генерал-лейтенанта.
Работа Гайда с личной охраной, 1918